A la suite du coup d'Etat des colonels en 1967, elle fut privee de ses droits civiques et s'exila en France. Lors de ses tournees de chant elle devint le porte parole dans ses chansons de la resistance greque a la dictature.
Des la chute du regime, elle rentre en Grece et entre en politique, Depute du Piree, Ministre de la Culture de 1981 a 1989, puis de 1993 jusqu'a sa mort. Pendant son premier mandat, elle a cree en 1985 le concept des capitales europeennes de la culture.
Durant sa carriere politique elle a egalement mene le combat aupres du gouvernement anglais pour le rapatriement des marbres de l'Acropole d' Athenes.
Aujourd'hui la Fondation Melina Merkouri s'occupe de la preservation des monuments Grecs Antiques.